一、臭氧相對其它消毒劑在食品行業應用中的優越性
1、臭氧作為高效廣譜無殘留污染的氣體消毒劑比食品行業常用的消毒劑具有特殊的優越性。與過氧乙酸、高錳酸鉀、甲醛（福爾馬林）、二氧化硫等化學消毒劑相比，其殺菌能力與過氧乙酸相當，高于其他消毒劑。
2、臭氧會自行分解為氧氣，不產生殘留污染，消毒后不需通風換氣。常規消毒均需通風換氣或化學中和，非常麻煩而又降低消毒效果。而臭氧可直接對食品使用作殺菌或防霉保鮮，為干法消毒，簡單易行。臭氧殺菌濃度對食品是極微弱的氧化濃度，對食品無害。
3、與紫外線照射殺菌比較：紫外線以光波輻射作用殺菌，只有照射到的位置且達到照射強度標準才有殺菌效果。食品加工車間很高，很大，照射強度與距離平方成反比，強度不夠，照射又有很大死角。臭氧為氣體，擴散性好，無死角，濃度均勻。紫外線殺菌在相對濕度60%以上時效果急劇下降，80%濕度以上時反可誘使細菌復活。臭氧則相反，濕度越高殺菌效果越好，對食品行業80～90%高濕度環境特別適合。食品加工車間安裝臭氧消毒設備費用與紫外線燈相當（16～18m3裝一支30W紫外燈設計標準），而運行費用由于臭氧設備省電，壽命長而大大降低，對于新建車間更為經濟。
二、臭氧在食品行業中的具體應用
1、食品原料的清洗殺菌
食品原料（生鮮肉、解凍肉、生鮮水產品、直接來自地里的蔬菜、水果等）往往攜帶大量的細菌、病毒和真菌，在加工前必須清洗殺菌。4ppm以上的臭氧水能在幾分鐘內顯著減少或完全消滅原料表面的各種微生物。臭氧水還可以降解果蔬原料中農藥化肥殘留。畜禽屠宰過程使用臭氧水沖洗酮體、內臟、人手、工具和地面，既可殺滅細菌，同時還可以有效去除異味。

2、冷藏間、冷藏庫的衛生消毒
臭氧水可用于對空庫地面、墻壁及擱物架，盛物箱進行徹底清洗消毒。臭氧空氣殺菌系統能有效抑制庫內各種微生物孳生，及時殺滅空氣中傳播的各種病菌，防止食品霉變腐爛。對于放置有裸露食品的冷庫，可以適當延長系統的開機時間。維持較高的臭氧濃度。
3、物體的表面消毒
在食品生產過程中，常常要對工作服、瓶蓋、原輔材料、工裝器具、包裝材料等進行表面消毒，常常使用消毒柜，傳遞窗等。傳統的方法是用紫外線燈照射，問題主要是在于消毒不徹底，所以，若使用在諸如傳遞窗等要求不高的場合是可以的，但遠不如使用臭氧的效果好。
4、無菌包裝間、無菌實驗室、生產車間的空氣殺菌消毒
雖然無菌包裝間的空氣大多已經過濾，但因各種原因空氣中仍然存在很多微生物，甚至大腸桿菌，長期連續使用臭氧空氣殺菌系統可以真正保障目標場所的無菌要求，重要的是正確確定臭氧的濃度以及系統的工作時間，并做到讓臭氧在場所內均勻分布，以滿足有效殺菌而不影響人員工作的目的。食品直接暴露在空氣中的加工車間，其空氣清潔衛生極其重要，化學噴霧或熏蒸的方法可能污染食品，紫外線燈除殺毒空間受到局限外，其殺菌效果受高濕環境和空間高度的影響而大打折扣。均勻分布、濃度適中的臭氧非常有效地解決了大空間的加工車間日常殺菌消毒的問題，不影響生產，無需專人管理。可根據不同生產班次安排確定適宜的系統工作程序。
5、對食品行業用水的消毒　
水是食品的成分之一。同時水也是一種食品污染源，利用臭氧處理的水作為生產用水既滅活了微生物，同時可除去水臭、水的色澤以及鐵和錳，尤其適合作為飲料用水。